Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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