Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
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