Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SP140Q13342 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SP140Q13342 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SP140Q13342 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SP140Q13342 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SP140Q13342 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SP140Q13342 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SP140Q13342 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SP140Q13342 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SP140Q13342 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SP140Q13342 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SP140Q13342 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SP140Q13342 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SP140Q13342 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SP140Q13342 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SP140Q13342 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
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SP140Q13342 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SP140Q13342 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
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SP140Q13342 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SP140Q13342 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SP140Q13342 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SP140Q13342 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
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SP140Q13342 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
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SP140Q13342 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
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SP140Q13342 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SP140Q13342 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
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SP140Q13342 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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SP140Q13342 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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SP140Q13342 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SP140Q13342 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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SP140Q13342 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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SP140Q13342 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SP140Q13342 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SP140Q13342 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SP140Q13342 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SP140Q13342 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SP140Q13342 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SP140Q13342 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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