Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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NR1H3Q13133 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
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NR1H3Q13133 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
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NR1H3Q13133 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
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NR1H3Q13133 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
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NR1H3Q13133 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
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NR1H3Q13133 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
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NR1H3Q13133 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
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NR1H3Q13133 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
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NR1H3Q13133 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
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NR1H3Q13133 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
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NR1H3Q13133 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
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NR1H3Q13133 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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NR1H3Q13133 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
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NR1H3Q13133 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
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