Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
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CHAF1BQ13112 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
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