Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 AL596244.1-201ENST00000567068 3779 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 ZMYM4-201ENST00000314607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 EOGT-201ENST00000295571 4138 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 AL591767.3-201ENST00000554632 525 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 LINC00624-201ENST00000619867 3088 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 FYB1-209ENST00000512982 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 AC083906.1-201ENST00000509298 406 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 AC016813.1-201ENST00000521511 735 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
MKRN3Q13064 AC087477.2-202ENST00000558499 4856 ntTSL 4 BASIC7.34□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AC105105.2-201ENST00000590797 4521 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 NEDD9-216ENST00000620854 4086 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
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