Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
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FOXF1Q12946 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
FOXF1Q12946 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
FOXF1Q12946 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
FOXF1Q12946 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXF1Q12946 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXF1Q12946 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXF1Q12946 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXF1Q12946 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXF1Q12946 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXF1Q12946 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXF1Q12946 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXF1Q12946 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXF1Q12946 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXF1Q12946 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXF1Q12946 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXF1Q12946 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXF1Q12946 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
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FOXF1Q12946 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
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FOXF1Q12946 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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FOXF1Q12946 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXF1Q12946 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXF1Q12946 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXF1Q12946 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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FOXF1Q12946 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXF1Q12946 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXF1Q12946 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXF1Q12946 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXF1Q12946 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXF1Q12946 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXF1Q12946 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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