Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
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CNTN1Q12860 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
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CNTN1Q12860 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
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CNTN1Q12860 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
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CNTN1Q12860 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
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CNTN1Q12860 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
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