Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ACADSBP45954 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms