Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRMP28827 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRMP28827 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRMP28827 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRMP28827 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRMP28827 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRMP28827 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRMP28827 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRMP28827 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRMP28827 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRMP28827 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRMP28827 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRMP28827 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRMP28827 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRMP28827 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRMP28827 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRMP28827 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRMP28827 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRMP28827 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRMP28827 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
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PTPRMP28827 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRMP28827 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRMP28827 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRMP28827 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRMP28827 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
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PTPRMP28827 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRMP28827 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRMP28827 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRMP28827 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRMP28827 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRMP28827 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRMP28827 XKRY2-202ENST00000623874 1581 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRMP28827 XKRY-202ENST00000624960 1581 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRMP28827 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRMP28827 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRMP28827 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRMP28827 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRMP28827 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRMP28827 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRMP28827 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRMP28827 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRMP28827 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRMP28827 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRMP28827 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRMP28827 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPRMP28827 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
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