Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SH3BP4Q9P0V3 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
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