Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ALYREFQ86V81 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.8 ms