Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.5 ms