Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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SSX1Q16384 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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SSX1Q16384 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
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SSX1Q16384 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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SSX1Q16384 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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SSX1Q16384 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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SSX1Q16384 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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