Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AL133372.1-201ENST00000493565 745 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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