Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NPTX1Q15818 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms