Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
UBE3CQ15386 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms