Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RAB39AQ14964 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.4 ms