Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
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COL9A2Q14055 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
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COL9A2Q14055 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
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COL9A2Q14055 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
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COL9A2Q14055 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
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COL9A2Q14055 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
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COL9A2Q14055 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
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