Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
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