Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
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TUBB3Q13509 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
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TUBB3Q13509 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
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TUBB3Q13509 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
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TUBB3Q13509 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
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TUBB3Q13509 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
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TUBB3Q13509 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
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TUBB3Q13509 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
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TUBB3Q13509 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
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TUBB3Q13509 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
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TUBB3Q13509 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
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TUBB3Q13509 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
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TUBB3Q13509 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
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TUBB3Q13509 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
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TUBB3Q13509 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
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TUBB3Q13509 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
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