Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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