Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
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CHAF1BQ13112 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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CHAF1BQ13112 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
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CHAF1BQ13112 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
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CHAF1BQ13112 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
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CHAF1BQ13112 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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CHAF1BQ13112 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
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