Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.81
PRDM2Q13029 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 UBE2V2P1-201ENST00000434717 398 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 XKRY2-202ENST00000623874 1581 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 XKRY-202ENST00000624960 1581 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms