Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 LINC01862-201ENST00000593792 478 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AL589740.1-201ENST00000457513 756 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms