Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.8 ms