Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
COL24A1Q17RW2 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COL24A1Q17RW2 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
COL24A1Q17RW2 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
COL24A1Q17RW2 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COL24A1Q17RW2 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
COL24A1Q17RW2 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
COL24A1Q17RW2 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
COL24A1Q17RW2 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
COL24A1Q17RW2 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
COL24A1Q17RW2 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
COL24A1Q17RW2 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
COL24A1Q17RW2 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
COL24A1Q17RW2 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
COL24A1Q17RW2 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
COL24A1Q17RW2 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
COL24A1Q17RW2 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
COL24A1Q17RW2 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
COL24A1Q17RW2 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
COL24A1Q17RW2 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
COL24A1Q17RW2 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
COL24A1Q17RW2 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
COL24A1Q17RW2 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
COL24A1Q17RW2 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
COL24A1Q17RW2 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
COL24A1Q17RW2 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
COL24A1Q17RW2 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
COL24A1Q17RW2 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
COL24A1Q17RW2 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
COL24A1Q17RW2 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
COL24A1Q17RW2 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
COL24A1Q17RW2 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
COL24A1Q17RW2 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
COL24A1Q17RW2 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
COL24A1Q17RW2 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
COL24A1Q17RW2 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
COL24A1Q17RW2 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
COL24A1Q17RW2 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
COL24A1Q17RW2 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
COL24A1Q17RW2 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
COL24A1Q17RW2 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
COL24A1Q17RW2 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
COL24A1Q17RW2 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
COL24A1Q17RW2 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
COL24A1Q17RW2 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
COL24A1Q17RW2 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
COL24A1Q17RW2 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
COL24A1Q17RW2 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
COL24A1Q17RW2 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
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COL24A1Q17RW2 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.94
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COL24A1Q17RW2 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
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COL24A1Q17RW2 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
COL24A1Q17RW2 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.94
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COL24A1Q17RW2 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
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COL24A1Q17RW2 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
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COL24A1Q17RW2 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
COL24A1Q17RW2 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
COL24A1Q17RW2 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
COL24A1Q17RW2 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
COL24A1Q17RW2 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
COL24A1Q17RW2 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
COL24A1Q17RW2 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
COL24A1Q17RW2 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
COL24A1Q17RW2 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
COL24A1Q17RW2 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
COL24A1Q17RW2 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
COL24A1Q17RW2 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
COL24A1Q17RW2 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
COL24A1Q17RW2 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
COL24A1Q17RW2 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
COL24A1Q17RW2 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
COL24A1Q17RW2 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
COL24A1Q17RW2 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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