Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.9 ms