Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
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CCDC142Q17RM4 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
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CCDC142Q17RM4 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
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CCDC142Q17RM4 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
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CCDC142Q17RM4 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
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CCDC142Q17RM4 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
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CCDC142Q17RM4 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
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CCDC142Q17RM4 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
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