Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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