Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC1.39□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC1.39□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AL356490.1-201ENST00000623079 479 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC1.39□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
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