Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PUM3Q15397 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
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