Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRKQ15262 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRKQ15262 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRKQ15262 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRKQ15262 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRKQ15262 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRKQ15262 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRKQ15262 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRKQ15262 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRKQ15262 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRKQ15262 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
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PTPRKQ15262 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRKQ15262 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRKQ15262 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRKQ15262 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRKQ15262 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRKQ15262 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRKQ15262 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRKQ15262 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRKQ15262 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRKQ15262 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRKQ15262 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRKQ15262 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRKQ15262 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRKQ15262 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRKQ15262 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRKQ15262 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRKQ15262 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
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PTPRKQ15262 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PTPRKQ15262 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
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PTPRKQ15262 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRKQ15262 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRKQ15262 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRKQ15262 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRKQ15262 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRKQ15262 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PTPRKQ15262 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
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PTPRKQ15262 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
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PTPRKQ15262 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
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PTPRKQ15262 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
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PTPRKQ15262 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
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PTPRKQ15262 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
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PTPRKQ15262 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPRKQ15262 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
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