Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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