Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms