Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
PKP1Q13835 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
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