Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
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