Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms