Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
MSLNQ13421 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
MSLNQ13421 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
MSLNQ13421 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
MSLNQ13421 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
MSLNQ13421 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
MSLNQ13421 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
MSLNQ13421 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
MSLNQ13421 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
MSLNQ13421 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
MSLNQ13421 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
MSLNQ13421 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
MSLNQ13421 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
MSLNQ13421 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
MSLNQ13421 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
MSLNQ13421 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
MSLNQ13421 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
MSLNQ13421 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
MSLNQ13421 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
MSLNQ13421 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
MSLNQ13421 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
MSLNQ13421 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
MSLNQ13421 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
MSLNQ13421 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
MSLNQ13421 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
MSLNQ13421 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
MSLNQ13421 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
MSLNQ13421 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
MSLNQ13421 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
MSLNQ13421 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
MSLNQ13421 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
MSLNQ13421 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
MSLNQ13421 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
MSLNQ13421 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
MSLNQ13421 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
MSLNQ13421 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
MSLNQ13421 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
MSLNQ13421 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
MSLNQ13421 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
MSLNQ13421 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
MSLNQ13421 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
MSLNQ13421 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
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MSLNQ13421 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
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MSLNQ13421 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
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MSLNQ13421 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
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MSLNQ13421 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
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MSLNQ13421 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
MSLNQ13421 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
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