Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIN2BQ13224 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIN2BQ13224 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIN2BQ13224 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIN2BQ13224 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIN2BQ13224 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIN2BQ13224 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIN2BQ13224 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIN2BQ13224 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIN2BQ13224 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIN2BQ13224 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIN2BQ13224 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
GRIN2BQ13224 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 VN1R96P-201ENST00000446052 858 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 LINC02463-201ENST00000546414 497 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIN2BQ13224 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms