Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3BQ13214 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
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SEMA3BQ13214 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
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SEMA3BQ13214 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
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SEMA3BQ13214 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
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SEMA3BQ13214 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
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SEMA3BQ13214 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
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SEMA3BQ13214 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
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SEMA3BQ13214 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
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SEMA3BQ13214 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SEMA3BQ13214 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
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