Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
TRAF3Q13114 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.2 ms