Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC6.27□□□□□ -1.4
NFX1Q12986 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NFX1Q12986 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NFX1Q12986 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
NFX1Q12986 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NFX1Q12986 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NFX1Q12986 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NFX1Q12986 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NFX1Q12986 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
NFX1Q12986 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NFX1Q12986 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NFX1Q12986 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NFX1Q12986 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NFX1Q12986 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NFX1Q12986 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NFX1Q12986 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NFX1Q12986 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
NFX1Q12986 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
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