Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 FYB1-209ENST00000512982 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 MTMR7-201ENST00000180173 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 UGT2B4-201ENST00000305107 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 C18orf54-206ENST00000620105 5693 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 SP110-201ENST00000258381 2426 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 GLRA3-201ENST00000274093 8770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 NXT2-203ENST00000372106 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 AC120057.5-201ENST00000623840 154 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 KIAA0040-206ENST00000619513 4340 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 CPNE4-208ENST00000511604 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 ARHGAP42P4-201ENST00000549782 2934 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 VN1R1-201ENST00000321039 2353 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 SAR1A-206ENST00000431664 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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FOXC1Q12948 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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FOXC1Q12948 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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