Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms