Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
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PGGT1BP53609 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
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PGGT1BP53609 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
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PGGT1BP53609 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
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PGGT1BP53609 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
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PGGT1BP53609 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
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