Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
HOXD10P28358 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
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