Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AC012409.1-202ENST00000558449 639 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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