Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
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PTPRBP23467 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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PTPRBP23467 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
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PTPRBP23467 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
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PTPRBP23467 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
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PTPRBP23467 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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PTPRBP23467 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
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PTPRBP23467 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
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PTPRBP23467 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPRBP23467 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
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