Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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RFXAPO00287 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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RFXAPO00287 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RFXAPO00287 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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